茶叶多组学综合数据库宣告
科技日报昆明8月7日电 (记者赵汉斌)记者7日从云南农业大学患上悉 ,茶叶该校盛军教授团队近期乐成宣告茶叶多组学综合数据库,多组为山茶属遗传育种提供了紧张的学综宣告数据反对于以及检索合成平台。植物迷信规模期刊《植物通讯》宣告了相关钻研下场 。合数
茶被天下卫负气关推选为六大瘦弱饮料之首,据库全天下有逾越20亿人饮茶。茶叶近些年来,多组随着基因组学技术普遍运用,学综宣告山茶属多组学数据迅猛削减,合数为茶叶生物学钻研带来新机缘以及多组学数据整合以及运用的据库新挑战,建树一个综合性数据库反对于茶叶基因钻研势在必行 。茶叶盛军团队临时自动于茶叶基因组 、多组成果成份及功能机理钻研,学综宣告群集并整合了山茶属多个参考基因组 、合数重测序 、据库转录组等组学数据,并将这些数据整合为8个根基模块,共群集265个种以及714个种类的分类信息 ,可知足人们对于山茶属生物资源信息的清晰。
团队中的云南农业大学教授董扬、博士钻研生李旭真还提供了搜罗泛基因组 、临沧茶树重测序与土壤宏基因组测序数据三项自力钻研,构建并宣告了山茶属多组学数据库——Teabase 。此外,盛军团队还开拓了引物妄想、基因组浏览器、基因表白魔难等一系列适用合成工具,知足钻研学者对于基因、变异位点、基因表白等信息的检索、合成、整合以及下载等需要。
据悉 ,这是天下上首个综合茶叶多组学数据库,收录了大批茶叶相关的多组学数据 ,一半以上数据为初次宣告,搜罗12个参考基因组以及一份泛基因组组装 、100份转录组,705份全天下茶叶种质资源的遗传信息、1350份云南临沧产区古树茶重测序及对于应的448份宏基因组测序数据,上亿条变异数据,为茶叶根基钻研以及遗传育种提供了紧张的数据清静台反对于,标志着我国茶叶基因组钻研迈向新阶段。
(责任编辑:休闲)
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